Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP4Q13115 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP4Q13115 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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