Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IFT88Q13099 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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