Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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