Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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