Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPTFQ12830 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPTFQ12830 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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