Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB40BQ12829 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms