Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TROQ12816 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TROQ12816 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TROQ12816 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TROQ12816 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TROQ12816 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms