Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCNA1Q09470 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms