Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLFN5Q08AF3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms