Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PUDPQ08623 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms