Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
POLEQ07864 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms