Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRKCDQ05655 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms