Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CD164Q04900 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CD164Q04900 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CD164Q04900 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CD164Q04900 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CD164Q04900 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CD164Q04900 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms