Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP7AQ04656 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP7AQ04656 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms