Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms