Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MS4A2Q01362 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MS4A2Q01362 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms