Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms