Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCBP4P57723 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms