Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRG3P56975 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NRG3P56975 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms