Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CTBP2P56545 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTBP2P56545 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms