Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP12AP54707 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms