Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGDP52209 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGDP52209 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PGDP52209 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PGDP52209 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGDP52209 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGDP52209 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGDP52209 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms