Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPIAP49247 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPIAP49247 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPIAP49247 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPIAP49247 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPIAP49247 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPIAP49247 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPIAP49247 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPIAP49247 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPIAP49247 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPIAP49247 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms