Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL1P40616 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL1P40616 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL1P40616 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARL1P40616 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARL1P40616 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARL1P40616 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARL1P40616 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms