Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHI3L1P36222 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms