Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORAP35398 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORAP35398 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORAP35398 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms