Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA3P34903 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms