Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CPS1P31327 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPS1P31327 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CPS1P31327 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPS1P31327 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPS1P31327 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPS1P31327 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms