Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CMPK1P30085 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms