Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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