Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPHA3P29320 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms