Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPREP23469 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPREP23469 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPREP23469 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPREP23469 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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