Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD53P19397 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CD53P19397 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CD53P19397 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms