Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HPGDP15428 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDP15428 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDP15428 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDP15428 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDP15428 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDP15428 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HPGDP15428 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HPGDP15428 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms