Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPRP12270 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPRP12270 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPRP12270 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPRP12270 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms