Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SP9P0CG40 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SP9P0CG40 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms