Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRPRAP08240 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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