Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POP4O95707 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POP4O95707 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms