Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms