Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC9O60706 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC9O60706 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC9O60706 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC9O60706 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC9O60706 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC9O60706 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms