Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GMDSO60547 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GMDSO60547 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GMDSO60547 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GMDSO60547 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GMDSO60547 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GMDSO60547 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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