Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNC1O60486 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms