Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OIP5O43482 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms