Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNAP23O00161 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAP23O00161 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms