Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
B4E171 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
B4E171 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
B4E171 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
B4E171 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms