Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms