Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms