Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SRRM4A7MD48 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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