Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID3CA6NKF2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms