Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SERINC4A6NH21 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms